尚书省管辖之下的四部分别是礼部，工部，民政部和财政部。
礼部尚书为孔子后裔孔拯，左侍郎山东人周江，右侍郎契丹人耶律瑾
工部尚书为苏咏霖旧部时征，左侍郎也是苏咏霖旧部乔云良，右侍郎是燕云汉人侯良哲。
民政部尚书为金国旧臣契丹人耶律元宜，左侍郎为山东人陈吉昌，右侍郎为燕云汉人韩先令。
财政部尚书为苏咏霖旧部林景春，左侍郎渤海人李宝成，右侍郎山东人曹凯。
行政系统之外为独立的司法系统，法部、大理寺和都察院。
如果说尚书省内苏咏霖还顾忌到了各方势力的平衡，那么司法三司之中，苏咏霖就彻底把自己的旧部提拔到了主导的位置之上。
法部尚书是苏咏霖旧部、总务局秘书处处长沈格，左侍郎也是他的旧部周琳，只有右侍郎是渤海人李修。
大理寺卿为苏咏霖旧部、原光复军军法处二把手蒋成月。
都察院左都御史为苏咏霖的绝对亲信田珪子，右都御史也是苏咏霖的亲信孔茂捷。
司法系统之外，更是苏咏霖不容触碰的逆鳞，军事系统。
新建立的大明帝国的军事系统分为枢密院和参谋院两个部分，枢密院负责管理军队日常和后勤，参谋院负责军队的具体指挥。
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